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近日,東京大學(xué)醫(yī)學(xué)研究所人類基因組解析中心在日立制作所的協(xié)助下,正式啟動(dòng)了人類基因組解析超級(jí)計(jì)算機(jī)“Shirokane3”。Shirokane3更新了系統(tǒng),使其解析速度提高到原來(lái)的10倍左右,可保存100萬(wàn)人份的數(shù)據(jù),有望加快癌癥、傳染病等疾病的個(gè)性化預(yù)防、診斷與治療方案的研究進(jìn)程。
該中心是日本通過(guò)人類基因組解析進(jìn)行醫(yī)學(xué)、生物學(xué)研究的核心據(jù)點(diǎn),致力于推進(jìn)人類基因組領(lǐng)域的尖端研究,實(shí)現(xiàn)了世界上首次由日本人進(jìn)行的人類基因組排序解析。
近年來(lái),隨著DNA氨基酸組合排列自動(dòng)讀取設(shè)備技術(shù)的進(jìn)步,快速獲取大量人類基因組信息已不再困難,因此對(duì)與之相應(yīng)的超級(jí)計(jì)算機(jī)性能有了更高的要求。超級(jí)計(jì)算機(jī)Shirokane3則實(shí)現(xiàn)了422 TFLOPS(每秒浮點(diǎn)運(yùn)算次數(shù))(1 TFLOPS為每秒萬(wàn)億次浮點(diǎn)運(yùn)算)的綜合理論演算性能,可以更加快速地在龐大的數(shù)據(jù)中檢索、確定出人類基因組中的變異之處。
【用語(yǔ)解釋】
(人類基因組解析)解析生物所具有的全部遺傳信息的組合,即人類基因組的構(gòu)造和機(jī)能。
(人類基因組排列)構(gòu)成各類染色體的氨基酸排列,表達(dá)遺傳信息。